Вторая функциональная зона соответствует антральному отделу желудка. Основной функцией антрального отдела слизистой оболочки желудка является секреция щелочного секрета, направленного на нейтрализацию кислого желудочного содержимого после окончания желудочной пищеварительной реакции.
На высоте пищеварения значения рН второй функциональной зоны смогут смещаться в кислую сторону, но в межпищеварительный период эти значения не превышают физиологических показателей рН = 4,0-5,0. Снижение рН меньше 4,0 в антральном отделе говорит о снижении нейтрализующей функции антрального отдела желудка и возможно также за счет смещения зоны кислотообразования в дистальный отдел желудка.
Третья функциональная зона соответствует зоне активного кислотообразования — кардинальному отделу желудка. Активность кислотообразования оценивается по ранее описанным функциональным интервалам.
Четвертая функциональная зона — зона пищевода. Физиологические значения рН = 5,0-6,0. При различных заболеваниях пищевода возможно смещение рН в кислую сторону до 2,0 и ниже. Такие значения рН могут быть при воспалительных изменениях в слизистой оболочке пищевода, при развитии рефлюкс-эзофагита, а также при имплантации в слизистую оболочку пищевода слизистой желудка (пищевод Баррета). На основании данных эндоскопической рН-метрии возможна оценка клиренса пищевода (времени нейтрализации заброшенного желудочного секрета в просвет пищевода секретом слизистых желез пищевода).