Пилюли хранят в сухом и прохладном месте для предупреждения размножения микроорганизмов, так как большинство вспомогательных веществ, используемых в технологии пилюль, является для них хорошей питательной средой (сироп сахарный, экстракты и т.п.). Заплесневение пилюль особенно часто возникает при наличии в пилюльной массе гигроскопических веществ (глицерина, сахара, сиропа и т.п.). Отсыревание может быть причиной химических реакции и образования новых веществ, в том числе ядовитых.