Хотя пилюльная масса не является средой, активирующей реакции взаимодействия между лекарственными веществами, случаи прописывания несовместимых сочетаний все же иногда имеют место. Например, нельзя прописывать в одном рецепте калия перманганат и экстракт алоэ, так как составные части экстракта алоэ легко окисляются калия перманганатом, а он, в свою очередь, восстанавливается до двуокиси марганца. Прописывание в рецепте йода кристаллического (окислителя) и кислоты аскорбиновой приведет к возникновению окислительно-восстановительной реакции и инактивации кислоты аскорбиновой. В пилюлях с хинином нельзя пользоваться в качестве вспомогательного вещества экстрактами корня солодки, так как образуются труднорастворимые соли.