Диагностика — хромоцистоскопия, при которой отмечается инъецированность сосудов слизистой оболочки в области устья мочеточника, из которого, как паста из тюбика, выходит густой гной, индигокармин на стороне поражения не выделяется.
На экскреторной урографии — рентгеноконтрастное вещество в пораженной почке либо совсем не выявляется, либо появляется только на поздних рентгенограммах (через 1,5-3 ч), имеются слабые бесформенные тени.
На ретроградных пиелограммах видны расширенные полости различной величины с неровными контурами, что подтверждается ультразвуковым сканированием, определяющим также истончение слоя паренхимы.
Пионефроз следует дифференцировать от поликистоза и опухоли почки. При поликистозе прощупывается и вторая увеличенная почка, так как заболевание двустороннее. При пионефрозе пальпируемая почка болезненна, тогда как пальпация почки при опухоли безболезненна. Существенное значение в диффдиагностике принадлежит ультразвуковому сканированию и компьютерной томографии.