Входными воротами являются слизистые оболочки верхних дыхательных путей и полости рта. Вирус реплицируется и накапливается в клетках эпителия, затем проникает в кровь (первичная вирусемия) и разносится в различные органы и ткани. Вирус гематогенным путем попадает в слюнные железы, размножается и вызывает местную воспалительную реакцию. Кроме того, вирус взывает поражение других железистых органов (яичек, поджелудочной железы) и нервной системы, однако симптомы их поражения возникают не с первых дней заболевания. При паротите могут наблюдаться признаки поражения железистых органов и без симптомов воспаления слюнных желез. В развитии осложнений имеет значение функциональное состояние органов и иммунной системы.