Патологическая анатомия сепсиса протекает с гнойными метастазами (септикопиемией). На 1-м месте по частоте стоит стафилококковая септикопиемия, которая может протекать в виде молниеносной и острой форм. Характерно наличие множественных метастазов, которые локализуются в легких, почках, сердце, головном мозге и т. д.
Стрептококковый сепсис часто проявляется в виде молниеносной формы септицемии (рожистый сепсис, тонзиллогенный сепсис и др.). Он характеризуется резкими дистрофическими изменениями органов, гиперплазией пульпы селезенки. Развивается эндокардит.
Пневмококковый сепсис в основном встречается у детей.
Менингококковый сепсис проявляется либо в виде острой или острейшей менингококкцемии, либо в виде гнойного менингита.
Анаэробный сепсис характеризуется желтым цветом кожи с бронзовым оттенком. Метастазы образуются в подкожной клетчатке. Наблюдаются гемолиз, миолиз, воспалительные и дегенеративно-некротические изменения во внутренних органах.