А. А. Бобров и Э. Лексер предложили эмболическую теорию происхождения гематогенного остеомиелита. Бактериальный эмбол из первичного очага инфекции, занесенный в кость током крови, оседает в одном из концевых сосудов. Этому способствуют общие узкие концевые артерии и замедление кровотока в них. Осевший эмбол служит источником гнойного процесса в кости.
Другой теорией патогенеза остеомиелита является работа С. М. Дерижанова (1937 г.), предложившая аллергическую основу патогенеза. Автор считает, что остеомиелит может возникнуть только в организме, сенсибилизированном латентной бактериальной флорой.
Первично — хронические формы остеомиелита развиваются в основном в результате действия резко ослабленной микрофлоры при достаточной сопротивляемости организма. В очаге поражения не возникает нагноения и деструкции костной ткани, и заболевание протекает атипично.