Нейтрализация ядов в желудочно-кишечном тракте возможна путем химического взаимодействия с ними. Раствор перманганата калия используется как оксидант при отравлении опиатами. Белый фосфор удается нейтрализовать сульфатом меди (0,3–0,5 г на полстакана теплой воды), причем образуется нерастворимая фосфористая медь.
Тиосульфат натрия нейтрализует токсичные соединения мышьяка, ртути, свинца путем образования неядовитых сульфитов, а токсичные цианиды превращает в менее ядовитые роданиды.
Нейтрализация парентерально всосавшихся ядов возможна с помощью химических антидотов. Унитиол связывает т.н. тиоловые яды — препараты мышьяка, ртути, хрома, висмута и других металлов, блокирующие сульфгидрильные группы ферментов.
Тиосульфат натрия образует нетоксичные сульфиты с растворимыми солями ртути, мышьяка, свинца, фосфора, фтора. Пеницилламин (купренил) образует растворимые комплексы с металлами, которые легко выводятся почками. Амилнитрит, нитрит натрия (метгемоглобинобразователи) применяются при отравлении цианидами. Глюкоза также оказывает специфическое антидотное действие при отравлении цианидами.