Глубокие язвы проникают за пределы стенки желудка или двенадцатиперстной кишки в соседний, спаянный с ней орган. При этом воспалительно-деструктивный процесс распространяется на эти органы — поджелудочную железу, желчные пути, печень, печеночно-желудочную или дуоденальную связку, малый сальник. Чаще всего пенетрируют язвы задней стенки луковицы двенадцатиперстной кишки. При рентгенологическом исследовании выявляется фиксированная ниша неправильной формы. Контур ее нечеткий, неровный. Содержимое, как правило, трехслойное — барий, жидкость, газ.