При типичном течении диагноз не представляет трудностей. При менее четкой симптоматике следует ориентироваться на данные эпиданамнеза (изучение возможных путей заражения) и сведения об эпизоотии ящура.
Лабораторные данные: показатели общего анализа крови малоспецифичны — пониженный уровень лейкоцитов и эозинофилия. Вирус выделяют из крови, слюны, афтозных элементов и фекалий. Идентификация вируса осуществляется при помощи РСК и РИГА в парных сыворотках с интервалом в 6-8 дней.
В целях диагностики используют биологическую пробу с втиранием содержимого афт в подушечки лапок морских свинок. При наличии вируса ящура у животных возникают типичные для инфекции высыпания.
Ящур дифференцируют от:
- афтозного;
- токсического и кандидозного стоматитов;
- герпетической инфекции;
- ветряной оспы;
- энтеровирусных заболеваний;
- пемфигуса.