Диагноз ставится на основе клинико-эпидемиологических и лабораторных данных. Лабораторная диагностика включает бактериоскопический и бактериологический методы, а в целях ранней диагностики применяют иммунофлюоресцентный метод. Применяют также аллергологическую диагностику сибирской язвы путем внутрикожной пробы с антраксином, дающей положительные результаты после 5-го дня болезни.
Материалом для лабораторного исследования являются: содержимое везикул и карбункулов, а также мокрота, кровь, испражнения и рвотные массы при септической форме.