В диагностике следует опираться на преимущественное развитие заболевания у лиц, которым не свойственны атопические реакции, возникновение жалоб после длительного контакта с аллергеном, характерную клиническую картину; данные рентгенологического исследования.
При острой форме экзогенных аллергических альвеолитов рентгенологически определяют усиление легочного рисунка, а также мелкоочаговые тени — от малозаметных до более очерченных. При подострой форме на рентгенограмме отмечаются распространенные узелковые тени и интерстициальный фиброз. При хронической форме выявляется распространенный пневмофиброз.
Исследования крови определяют наличие лейкоцитоза, С-реактивного белка, повышенной СОЭ. Серологические исследования позволяют выявить различные виды антител к предполагаемым аллергенам. Это особенно важно при подострых и хронических формах, когда контакт с аллергеном не ясен. Применяют иммуноферментный, радиоиммунологический, иммунофлюоресцентный методы. Используются также аллергические диагностические пробы — обычно внутрикожные, реже — ингаляционные. Наилучший результат получается с антигенами птиц (сывороткой крови или пометом), менее четкий — с грибковыми антигенами вследствие возможных неспецифических реакций.
Дифференцировать экзогенные аллергические альвеолиты обычно приходится с идиопатическим фиброзирующим альвеолитом, саркоидозом, пневмониями инфекционной природы, диссеминированным туберкулезом легких.