Возбудитель лепры — Mycobacterium leprae, открытый норвежским врачом А. Гансеном в 1873 г. (описан в 1874 г.), представляет собой грамположительные, кислото — и спиртоустойчивые палочки длиной 2—7 мкм и диаметром 0,2—0,5 мкм, окрашивающиеся по методу Циля-Нильсена в красный цвет. По форме, размерам, тинкториальным свойствам и способу размножения (поперечным делением) M. leprae близки к возбудителю туберкулеза.
Однако, в отличие от последнего, их до сих пор не удалось культивировать in vitro на питательных лабораторных средах, включая и культуры клеток. Поэтому существуют большие трудности с получением диагностических препаратов, не создана профилактическая вакцина. M. leprae — облигатные внутриклеточные паразиты клеток системы мононуклеарных фагоцитов, отличаются необычно длительным для бактерий циклом размножения: время их генерации, т.е. одного деления в тканях экспериментально зараженных животных, составляет 12—13 суток. Известно также, что при определенных условиях M. leprae способны длительно (годами) сохранять жизнеспособность вне организма-хозяина. Антигены M. leprae отличаются низкой иммуногенностью.
Основным путем передачи лепрозной инфекции считается воздушно-капельный, но признается возможность заражения и через кожу (при нарушении ее целостности). Лепра является значительно менее контагиозным заболеванием, чем, например, туберкулез. Обычно для заражения требуется длительное семейное сожительство («болезнь семейного обихода») при наличии повышенной иммуногенетической восприимчивости.
Решающим в патогенетическом механизме развития лепры является наличие дефектов функционирования макрофагального звена и Т-лимфоцитов организма-хозяина. Клинические проявления лепрозного процесса отражают спектр этих иммунопатологических изменений организма.