В фазе I при фракционном зондировании при патологии отмечается гиперсекреция (выделение более 45 мл содержимого) и гипосекреция (менее 15 мл за 30 мин наблюдения). Гипосекреция данной фазы дуоденального зондирования может быть связана с нарушением проходимости крупных внепеченочных и общего желчного протоков, а также с патологией экскреторной функции печени. Отсутствие порции А может наблюдаться в острый период вирусного гепатита, при закупорке общего желчного протока. Гиперсекреция первой фазы характерна для «отключенного» желчного пузыря и постхолецистэктомического состояния, гемолитической желтухи.
Может наблюдаться изменение цвета содержимого порции А: бледная окраска бывает при разбавлении панкреатическим соком, вследствие малого поступления прямого билирубина в желчь и задержке его в крови при печеночной (гепатиты, циррозы, доброкачественные гипербилирубинемии) и подпеченочной (закупорка желчных протоков камнем, сдавливание опухолью) желтухах, интенсивная окраска (плейохромия) обусловлена повышенным содержанием билирубина в желчи и особенно характерна для надпеченочной желтухи (усиленный гемолиз).
Обнаружение хлопьев слизи (особенно мелких, медленно оседающих на дно) в средних фракциях спокойно вытекающего секрета порции А при условии постоянного оттока желудочного сока может свидетельствовать о воспалении двенадцатиперстной кишки — дуодените (при нахождении лейкоцитов вместе с высоким каемчатым цилиндрическим эпителием) или холедохите, сфинктерите Одди (при наличии характерного крупного узкого цилиндрического эпителия общего желчного протока и лейкоцитов). Диффузное помутнение свидетельствует в большинстве случаев о наличии примеси в дуоденальном содержимом желудочного сока и объясняется образованием солей желчных кислот, вытесненных соляной кислотой из парных соединений.
Относительно оценки фазы II дуоденального исследования фракционного зондирования единого мнения нет. Согласно именно одних авторов удлинение «секреторной паузы» свыше 10 мин свидетельствует о гипертонусе сфинктера Одди, согласно мнению других — фаза II не дает истинного представления о состоянии конечного отдела общего желчного протока, так как зависит от многих факторов — функционального состояния двенадцатиперстной кишки, поджелудочной железы, печени и желчевыводящих путей.
Увеличение количества желчи в фазе III наблюдается при расширении общего желчного протока (холедохит, закупорка желчного пузыря), уменьшение — при недостаточности функции печени (гипосекреции желчи всех трех порций — А, В, С).
В фазе IV может обнаружиться стойкое отсутствие пузырного рефлекса, что возможно при частичном или полностью нефункционирующем желчном пузыре (закупорка пузырного и общего желчного протока камнем, сдавление опухолью, сморщивание желчного пузыря, его атония, воспалительное набухание слизистой оболочки пузырного протока и др.).
Изменение количества порции В и характера пузырного рефлюкса отмечается при дискинезии желчных путей: увеличение объема пузырной желчи и замедленное (прерывистое) опорожнение пузыря свойственны гипомоторной дискинезии, быстрое, но не полное опрожнение — гипермоторной дискинезии. Увеличение интенсивности окраски характерно для гемолиза (при этом усилен цвет и порций А, С), темная с зеленоватым оттенком (от присутствия биливердина) желчь может быть обусловлена застоем (одновременно повышается вязкость желчи) и воспалением (обнаруживаются хлопья слизи с присутствием в них больших вакуолизированных эпителиальных клеток), желчного пузыря. Слабая (почти белая) окраска порции В объясняется разрушением желчных пигментов и образованием их лейкосоединений (при хроническом калькулезном холецистите и закупорке желчного пузыря).
Медленное (8—20 капель/мин) и с паузами отделение желчи может зависеть от нарушения экскреторной функции гепатоцитов (при ее недостаточности отмечается плохая секреция всех трех порций), изменений коллоидальных свойств желчи, свойственных желчно-каменной болезни, о чем свидетельствует биохимическое и микроскопическое (обнаружение кристаллов холестерина, глыбок билирубината кальция, микролитов) исследование желчи, нарушение проходимости внепеченочных желчных протоков. Придают значение нахождению в средней чистой фракции С хлопьев слизи (с идентификацией мелкого призматического эпителия желчных ходов и лейкоцитов) для диагностики холангита.