Диморфные грибы
Blastomyces dermatitidis — соскобы папул, язв, биоптаты слизистой носа, рта, зева, мокрота, отделяемое свищей, секвестров кости, моча, аспират абсцессов, биоптаты органов.
Coccidioides immitis — мокрота, спинно-мозговая жидкость, биоптаты очагов поражений кожи, внутренних органов, отделяемое свищей, абсцессов.
Histoplasma capsulatum. var. capsulatum — мокрота, отделяемое язв языка, глотки, биоптаты очагов поражений кожи, слизистых оболочек внутренних органов, моча, аспират костного мозга, биологических жидкостей, лимфатических желез.
Histoplasma capsulatum. var. duboisii — биоптаты кожных поражений, аспираты инфильтратов, абсцессов, подкожных гранулем, отделяемое свищей, секвестров кости, абсцессов мягких тканей.
Loboa loboi — биоптаты узелков кожи, папул, бородавчатых образований кожи, инфильтратов, лимфатических желез.
Paracoccidioides brasiliensis — соскобы язв кожи, слизистых, мокрота, гной, биоптаты лимфатических желез, кожи, внутренних органов.
Penicillium mameffei — соскобы язв кожи, слизистых, мокрота, биоптаты тканей, органов.
Sporothrix schenckil — выделения язв кожи, микроабсцессов, свищей, пунктатов лимфатических желез, биоптаты тканей, органов.
Неклассифицированные патогенные грибы
Pneumocystis carinii — мокрота, аспират бронхов, биоптаты тканей, органов.
Rhinosporidium seeberi — отделяемое полипообразных очагов, биоптаты полипов, папиллом, гиперплазии слизистых оболочек, микроабсцессов слизистых.