Aspergillus род — гематоксилин-эозином, по Ван-Гизону, PAS (различные модификации: по Хочкиссу—Мак—Манусу, по Шабадашу), по Гридли, по Гомори—Грокотту, акридиновым оранжевым, флюоресцирующими антителами.
Blastomyces dermatitidis — гематоксилин-эозином, по Грам—Вейгерту, PAS (различные модификации: по Хочкиссу—Мак—Манусу, по Шабадашу), по Гридли, по Гомори—Грокотту, акридиновым оранжевым, флюоресцирующими антителами, альциановым синим.
Candida род — раствором Люголя, гематоксилин-эозином, по Ван—Гизону, по Граму, по Грам—Вейгерту, по Брауну—Бренну, PAS (различные модификации: по Хочкиссу—Мак-Манусу, по Шабадашу), по Гридли, по Романовскому—Гимза, по Райту, по Гомори—Грокотту, акридиновым оранжевым, флюоресцирующими антителами.
Chrysosporium parvum var. crescens — гематоксилин-эозином, PAS (различные модификации: по Хочкиссу—Мак-Манусу, по Шабадашу), по Гридли, по Гомори—Грокотту.
Coccidioides immltis — гематоксилин-эозином, по Ван—Гизону, по Грам—Вейгерту, PAS (различные модификации: по Хочкиссу—Мак-Манусу, по Шабадашу), по Гридли, по Романовскому—Гимза, по Райту, по Гомори—Грокотту, акридиновым оранжевым, флюоресцирующими антителами.
Cryptococcus род — гематоксилин-эозином, по Грам—Вейгерту, PAS (различные модификации: по Хочкиссу—Мак-Манусу, по Шабадашу), по Гомори—Грокотту, акридиновым оранжевым, флюоресцирующими антителами, альциановым синим, муцикармином по Мейеру.
Epidermophyton floccosum — флюоресцирующими антителами.
Fusarium род — флюоресцирующими антителами.
Geotrichum род — гематоксилин-эозином, по Граму, по Грам—Вейгерту, PAS, (различные модификации: по Хочкиссу—Мак-Манусу, по Шабадашу), по Гомори—Грокотту.
Histoplasma capsulatum — гематоксилин-эозином, по Ван—Гизону, Грам Вейгерту, PAS (различные модификации: по Хочкиссу—Мак—Манусу, по Шабадашу), по Гридли, по Бауэру, по Романовскому—Гимза, по Райту, по Гомори—Грокотту, акридиновым оранжевым, флюоресцирующими антителами.
Loboa loboi — гематоксилин-эозином, по Гридли, по Гомори—Грокотту.
Maklassezia род — метиленовым синим, гематоксилин-эозином, PAS (различные модификации: по Хочкиссу—Мак-Манусу, по Шабадашу) Microsporum род — флюоресцирующими антителами.
Paracoccidioides brasiliensis — гематоксилин-эозином, по Грам—Вейгерту, PAS (различные модификации: по Хочкиссу—Мак-Манусу, по Шабадашу), по Гомори—Грокотту, акридиновым оранжевым, Penicillium marneftei — гематоксилин—эозином, по Романовскому—Гимза, по Гомори—Грокотту.
Pneumocystis carinii — по Бауэру, по Гомори—Грокотту.
Pseudallescheria boydii — флюоресцирующими антителами.
Rhinosporidium seeberi — гематоксилин-эозином, по Ван—Гизону, по Грам Вейгерту, PAS (различные модификации: по Мак-Манусу, по Шабадашу), по Гомори—Грокотту, муцикармином по Мейеру, акридиновым оранжевым.
Scopulariopsis brevicaulis — флюоресцирующими антителами;
Sporothrix schenckii — гематоксилин-эозином, по Грам—Вейгерту, PAS (различные модификации: по Хочкиссу—Мак-Манусу, по Шабадашу), по Романовскому—Гимза, по Гомори—Грокотту, акридиновым оранжевым.
Trichophyton род — флюоресцирующими антителами.
Гиалогифомицеты — гематоксилин-эозином, PAS (различные модификации: по Хочкиссу—Мак-Манусу, по Шабадашу), по Гридли, по Гомори—Грокотту.
Дерматофиты — метиленовым синим, гематоксилин-эозином, PAS (различные модификации: по Хочкиссу—Мак-Манусу, по Шабадашу).
Зигомицеты — гематоксилин-эозином, PAS (различные модификации: по Хочкиссу—Мак-Манусу, по Шабадашу), по Романовскому—Гимза, по Гомори—Грокотту.
Феогифомицеты — гематоксилин-эозином, PAS (различные модификации: по Хочкиссу—Мак-Манусу, по Шабадашу), по Гридли, по Гомори—Грокотту.